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卷一
- 仰人周身總穴圖
- 伏人周身總穴圖
- 鍼道源流
- 針灸直指
- 針灸方宜始論（以下至刺法論俱素問）
- 刺熱論
- 刺瘧論
- 刺欬論
- 刺腰痛論
- 奇病論
- 刺要論
- 刺齊論
- 刺志論
- 長刺節論
- 皮部論
- 經絡論
- 骨空論
- 刺水熱穴論
- 調經論
- 繆刺論
- 經刺論
- 巨刺論
- 手足陰陽流注論
- 衛氣行論
- 診要經絡論
- 刺禁論
- 五奪不可瀉
- 四季不可刺 死期不可刺
- 刺法論
- 五刺應五臟論
- 九刺應九變論
- 十二刺應十二經論
- 手足陰陽經脈刺論
- 標本論
- 刺王公布衣
- 刺常人黑白肥瘦
- 刺壯士
- 刺嬰兒
- 人身左右上下虛實不同刺
- 難經
- 五邪舉心為例圖
卷二
卷三
卷四
- 五運主病歌（醫經小學）
- 六氣為病可歌
- 百穴法歌（神應經）
- 十二經脈歌（聚英）
- 玉龍歌（楊氏註解）
- 勝玉歌（楊氏）
- 雜病穴法歌（醫學入門）
- 雜病十一穴歌（聚英）
- 長桑君天皇祕訣歌（以下乾坤生意）
- 馬丹陽天星十二穴治雜病歌
- 四總穴歌
- 肘後歌（聚英）
- 回陽九針歌
- 針內障祕（楊氏）
- 針內障要歌
- 補瀉雪心歌（以下俱聚英）
- 行針總要歌
- 刺法啟玄歌
- 針法歌
- 策（諸家得失策 頭不多灸策 穴有奇正策 針有淺深策）
卷五
- 仰人伏人尺寸圖（以下俱醫統）
- 背穴腹穴尺寸圖
- 背部穴俞歌
- 腹部中穴歌
- 頭部
- 背部
- 腹部
- 中指同身寸圖
- 素問九針論
- 九針式
- 九針圖
- 製針法
- 煮針法
- 火針
- 溫針
- 治折針法
- 內經補（素問）
- 難經補瀉（難經本義）
- 神應經補瀉（本經）
- 瀉訣直說
- 補訣直說
- 南豐李氏補瀉
- 圓明高氏補瀉
- 呼吸
卷六
- 三衢楊氏補瀉十二字分次第手法及歌（玄機祕要）
- 下手八法口訣
- 生成數（聚英）
- 問經脈有奇經八脈設為問答（楊氏）
- 問迎隨之法
- 問補針之要法
- 問瀉針之要法
- 問經絡
- 問子午補瀉
- 問針頭補瀉何如
- 問候氣之法何如
- 問呼吸之理
- 問迎隨之理何如
- 問疾徐之理
- 問補瀉得宜
- 問自取其經
- 問補者從衛取氣瀉者從榮置氣
- 問皮內筋骨脈病
- 問刺有久速
- 問諸家刺齊異同
- 問陰陽居易之理
- 問順道相反之由
- 問虛實塞熱之治
- 問補者從衛取氣瀉者從榮置氣
- 問刺陽者臥針而刺之刺者按令陽散乃內針
- 問能佑迎隨之氣可令調之
- 問補瀉之時與氣開闔相應否
- 問十刺之時必在陽及與兩衛神屬勿去知病存亡
- 問容針空豆許
- 問刺有大小
- 問穴在骨所
- 問補瀉得宜
- 問迎奪隨濟固言補瀉其義何如
- 問針入幾分留幾呼
- 問補瀉有不在廿井榮俞經合者多如何
- 問經穴流注按時補瀉病在各經絡按時能去病否
- 問針形至微何能補瀉
- 問內經治病湯藥少而針灸多何也
- 問八法流注之要訣何如
- 禁針穴歌
- 禁灸穴歌（以下俱醫統）
- 太乙歌
- 九宮尻神禁忌圖
- 九部人神禁忌歌
- 十干人神
- 十二支人神
- 十二部人神禁忌歌
- 四季人神歌
- 日人神歌
- 逐時人神
- 逐月血忌歌
- 逐月血支歌
- 四季避忌日
- 男避忌日
- 女避忌日
- 針灸服藥吉日
- 針灸忌日
- 十干日不治病
卷七
- 十二經井穴圖（楊氏）
- 井榮俞原經合歌（醫經小學）
- 井榮俞原經合橫圖
- 徐氏子午流注逐日按時定穴歌
- 十二經納天干歌（以下俱徐氏）
- 十二經納地支歌
- 腳不過膝手不過肘歌
- 流注圖
- 論子午流注法
- 流注開闔
- 流注時日
- 臟腑井榮俞經合主治（以下俱聚英）
- 總論
- 十二經是動所生病補瀉迎隨
- 十二經之原歌
- 十二經病井榮俞經合補瀉虛實
- 十二時血多少歌
- 十二經治症主客原絡圖 （楊氏）
- 靈龜取法飛騰針圖(徐氏)
- 八法歌
- 八法交會八脈
- 八法交會歌
- 八脈交會八穴歌
- 八脈配八卦歌
- 八穴配合歌
- 刺法啟玄歌
- 八法五虎建元日時歌
- 八法逐日干支歌
- 八法臨時干支歌
- 推定六十甲子日時穴開圖例
- 八法手訣歌
卷八
- 臟腑正背面圖（以下俱楊氏）
- 臟腑十二經穴起止歌
- 肺臟圖
- 手太陰肺經穴歌（醫學入門）
- 大腸腑圖
- 手陽明大腸經穴歌
- 胃腑圖
- 足陽明胃經穴歌
- 脾臟圖
- 足太陰脾經穴歌
- 心臟圖
- 手少陰心經穴歌
- 小腸腑圖
- 手太陽小腸經穴歌
- 膀胱腑圖
- 足太陽膀胱經穴歌
- 腎臟圖
- 足少陰腎經穴歌
- 仰人經圖（以下俱醫統）
- 伏人經圖
- 十四經脈長短尺寸
- 心包絡腑圖（以下至督脈圖俱楊氏集）
- 手厥陰心包絡經穴歌
- 三焦腑圖
- 手少陽三焦經穴歌
- 膽腑圖
- 足少陽膽經穴歌
卷九
- 肝臟圖
- 足厥陰肝經穴歌
- 任脈圖
- 任脈經血歌
- 督脈圖
- 督脈經穴歌
- 督任要穴圖（楊氏）
- 奇經八脈歌（醫經小學）
- 奇經八脈（以下俱節要）
- 十五絡脈歌
- 十五絡脈穴辯
- 十五絡脈
- 十二經筋
- 五臟募（聚英）
- 五臟俞穴
- 八會
- 看部取穴
- 治病要穴（醫學入門）
- 頭部
- 腹部
- 背部
- 手部
- 足部
- 經外奇穴（楊氏）
- 穴同名異類（聚英）
- 一穴二名
- 一穴三名
- 一穴四名
- 一穴五名
- 一穴六名
- 名同穴異類
卷十
- 穴法圖（以下俱神應經）
- 神應經用針咒
- 諸風門
- 傷寒門
- 痰喘咳嗽門
- 諸般積聚門
- 腹痛脹滿門
- 心脾胃門
- 心邪癲狂門
- 霍亂門
- 瘧疾門
- 腫脹門（附紅疸 黃疸）
- 汗門
- 痺厥門
- 腸痔大便門
- 陰尢小便門
- 頭面門
- 咽喉門
- 耳目門
- 鼻口門
- 胸背 門
- 手足腰腋門
- 婦人門
- 小兒門
- 瘡毒門
- 續增治法 中風論
- 初中寒急救針法（乾坤生意）
- 中風癱瘓針灸祕訣
- 治虛損五勞七傷緊要灸穴
- 雜病
- 諸瘡
卷十一
- 治症總要
- 東垣針法（聚英）
- 名醫治法（聚英） 瘡毒
- 喉痺
- 淋閉
- 眼目
- 損傷
- 針邪祕要（楊氏）
- 孫真人針十三鬼穴歌
- 捷要灸法（醫學入門）
- 崔氏取四花穴法
- 取膏穴法
- 騎竹馬灸穴
- 灸勞穴法
- 取腎俞穴法
- 取灸心氣法
- 取灸痔漏法
- 灸小腸尢氣穴法
- 灸腸風下血法
- 灸結胸傷寒法
- 灸陰毒結胸法
- 雷火針法
- 蒸臍治病法
- 相天時
- 千金灸法
- 寶鑑發灸法
- 艾葉
- 艾灸補瀉
- 艾炷大小
- 點艾火
- 壯數多少
- 灸法
- 炷火先後
- 灸寒熱
- 灸瘡要法
- 貼灸瘡
- 灸瘡膏法
- 洗灸瘡
- 灸後調攝法
- 醫案